يمكن أن تتفاعل العديد من مكونات النظام القضائي مع أنشطة هيئات إدارة الانتخابات. وقد تحتاج هيئات إدارة الانتخابات إلى التعاون مع الشرطة والسلطات النيابية في التحقيق في دعاوى المخالفات الانتخابية والحضور أمام المحاكم الجنائية أو المحاكم الإدارية في أي إجراء يتم في المحكمة. وقد تخضع هيئة إدارة الانتخابات أو أعضاؤها أو موظفوها، للتحقيق القضائي أو تقام ضدهم دعاوى مدنية، كما قد تتعرض ممارسات هيئة إدارة الانتخابات وسياساتها الإدارية للطعن عليها أمام الهيئات القضائية. أما بالنسبة لعلاقات مع هيئات تسوية النزاعات الانتخابية، فمن المهم بشدة أن تتسم هيئة إدارة الانتخابات بالمهنية، وسهولة الوصول إليها، والتعاون في تعاملاتها مع النظام القضائي الأعم.
