La mise en œuvre des instruments électoraux de démocratie directe (référendums, initiatives populaires, votes de révocation) soulève des questions pour la plupart identiques à celles qu’induit la conduite des élections. Il peut également être nécessaire de vérifier que les procédures de convocation aux scrutins de démocratie directe sont correctement appliquées (question polémique lors du vote de révocation de la présidence du Venezuela en 2004, par exemple) et de réglementer les campagnes électorales ainsi que l’éducation et l’information des électeurs. L’OGE de l’État américain de l’Oregon est tenu de distribuer dans chaque foyer une synthèse des prises de position des citoyens sur chaque question soumise au référendum.
Les OGE sont habituellement chargés de l’organisation des élections et de la mise en œuvre des instruments de démocratie directe. Au Royaume-Uni, bien que la Commission électorale ne joue pas le rôle d’un OGE pour les élections (qui sont gérées selon une structure de modèle gouvernemental), elle assume cette responsabilité pour les référendums.
