La confection d’un budget base zéro commence avec la préparation, par chaque division de l’OGE, d’un projet de budget pour son plan de travail. Ce projet de budget présente les besoins de la division en matière de financement et autres ressources, la manière dont ses activités permettront l’atteinte des résultats prévus dans le plan stratégique et les indicateurs de performance. Une fois les activités convenues au niveau de la division, ces budgets sont examinés, souvent par un comité de cadres supérieurs présidé par le chef du secrétariat ou le comptable principal de l’OGE, pour s’assurer que les projets de budget des divisions sont réalistes et reflètent une compréhension commune des objectifs stratégiques et des priorités de l’OGE. Le chef du secrétariat de l’OGE intègre alors tous les chiffres et finalise le projet de budget total de l’OGE qui, dans certains OGE, doit alors être approuvé par les membres (ou le président) de l’OGE. Dans l’OGE de modèle gouvernemental, tout ce processus peut être conduit par le ministère auquel l’OGE est rattaché.
Ensuite, en général, le chef du secrétariat ou le président de l’OGE transmet le budget au ministère compétent. Dans les pays où l’approbation de ce ministère est exigée pour le projet de budget de l’OGE, une audience budgétaire officielle peut être organisée. L’OGE de l’Afrique du Sud soumet son budget au pouvoir législatif par l’intermédiaire du ministère des Affaires intérieures, mais ce dernier n’a pas le pouvoir de le modifier. Cependant, le ministère des Finances peut réduire le projet de budget de l’OGE : un tel cas s’est présenté en 1999, entraînant la démission du président de l’OGE en guise de protestation. Parmi les OGE dont les projets de budget ne peuvent pas être modifiés par l’exécutif ou le pouvoir législatif figurent le Costa Rica et le Ghana. C’est une pratique commune pour le ministère des Finances d’incorporer le budget de l’OGE dans le budget national pour son dépôt à l’assemblée législative. Il peut être présenté par un membre de l’assemblée, souvent un ministre du ministère de tutelle de l’OGE.
